44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4853 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 421 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  73.98 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  54.66 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  50.37 
 
 		 426 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  46.13 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  40.45 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  37.41 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  36.91 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  34.78 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  28.21 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  28.21 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  30.87 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  28.62 
 
 		 327 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  33.66 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.58 
 
 		 325 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  34.09 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  34.09 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.62 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  32.97 
 
 		 332 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  32.23 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 		 992 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 994 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  27.61 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1621 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  26.86 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  32.39 
 
 		 599 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  29.85 
 
 		 1219 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1779 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1448 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  31.25 
 
 		 1141 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 644 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.75 
 
 		 720 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1321 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1083 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1711 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  30.07 
 
 		 560 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  34.58 
 
 		 982 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  32.88 
 
 		 724 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.13 
 
 		 934 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.71 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1544 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  32.88 
 
 		 596 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1911 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>