More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3272 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  100 
 
 
801 aa  1573    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  51.64 
 
 
457 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  35.28 
 
 
1056 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
911 aa  271  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
785 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  34.22 
 
 
829 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.34 
 
 
963 aa  234  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26 
 
 
1039 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.84 
 
 
1068 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  29.15 
 
 
845 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.42 
 
 
1131 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
1050 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.1 
 
 
675 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  30.29 
 
 
897 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  31.7 
 
 
934 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  29.27 
 
 
843 aa  201  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
1288 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 
1424 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 
1000 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
1262 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
1088 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.5 
 
 
859 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
1185 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.88 
 
 
713 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  30.85 
 
 
900 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  29.28 
 
 
849 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
1128 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
1105 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  44.4 
 
 
751 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.36 
 
 
992 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.54 
 
 
1324 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.26 
 
 
1523 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.78 
 
 
793 aa  173  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
1283 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  26.49 
 
 
1500 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.74 
 
 
1314 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.43 
 
 
672 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  29.31 
 
 
847 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.89 
 
 
767 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
814 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.67 
 
 
1309 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 
924 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.47 
 
 
899 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
568 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 
568 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
454 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 
1186 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.7 
 
 
1212 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
577 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  34.2 
 
 
825 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.23 
 
 
828 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.64 
 
 
284 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 
1146 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
1125 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 
1136 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
1215 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.74 
 
 
680 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.97 
 
 
1228 aa  141  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 
1311 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.5 
 
 
822 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
843 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  37.24 
 
 
362 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.31 
 
 
1328 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
837 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.09 
 
 
1509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  25.99 
 
 
1383 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.56 
 
 
1404 aa  127  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.95 
 
 
838 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.69 
 
 
771 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
949 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
857 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  34.23 
 
 
919 aa  124  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  33.86 
 
 
1488 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.15 
 
 
1261 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  36.62 
 
 
311 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 
787 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
444 aa  114  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.02 
 
 
1040 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
966 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.45 
 
 
1010 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  36.4 
 
 
702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
953 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 
991 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.79 
 
 
2145 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  31.06 
 
 
1468 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 
885 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
640 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.86 
 
 
493 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  32.85 
 
 
1475 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.32 
 
 
1550 aa  99  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 
212 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  37.57 
 
 
304 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.63 
 
 
725 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  33.6 
 
 
373 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.26 
 
 
1044 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.04 
 
 
1106 aa  94.7  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
1290 aa  94  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 
1507 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>