204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1912 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1144    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  47.36 
 
 		 1119 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  52.92 
 
 		 702 aa  223  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.36 
 
 		 2145 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 649 aa  180  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  36.09 
 
 		 994 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 639 aa  158  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 1147 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1437 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  32.76 
 
 		 665 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.84 
 
 		 1611 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 455 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 1186 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1550 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 878 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 810 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  38.36 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  29.55 
 
 		 762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.19 
 
 		 767 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.82 
 
 		 732 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 		 1507 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  39.13 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1404 aa  100  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.36 
 
 		 1328 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 1266 aa  97.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 817 aa  94.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 1363 aa  93.6  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 1476 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 843 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1285 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.84 
 
 		 825 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 		 725 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1215 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1123 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.64 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  19.5 
 
 		 782 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  33.23 
 
 		 830 aa  80.9  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  34.4 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 		 730 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1105 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1060 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.23 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.08 
 
 		 1009 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1212 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 997 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.52 
 
 		 1228 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1082 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.06 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 924 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.09 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  19.58 
 
 		 985 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.81 
 
 		 1737 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 824 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 991 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.97 
 
 		 620 aa  67  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.72 
 
 		 694 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  28.82 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 4489 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 		 885 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.82 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 3035 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 1486 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1028 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.12 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  27.32 
 
 		 724 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 		 991 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  26.49 
 
 		 1141 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.08 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.19 
 
 		 1044 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 837 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.75 
 
 		 1424 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  24.04 
 
 		 1087 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.54 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1054 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.81 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 1288 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  27.56 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.9 
 
 		 1694 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.65 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  26.8 
 
 		 340 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  21.32 
 
 		 2327 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 1114 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.37 
 
 		 1180 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 3560 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>