15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0606 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 		 1621 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 994 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1247 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1779 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1544 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  31.07 
 
 		 393 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.04 
 
 		 1219 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1321 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 1711 aa  95.9  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1083 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  32.28 
 
 		 552 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  36.96 
 
 		 992 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1448 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>