More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1349 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  196  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 98 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  72.53 
 
 		 101 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  69.15 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  65.98 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  65.98 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 97 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 99 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  60.42 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  64.84 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  64.77 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  48.39 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  42.42 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  44.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1786  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365144  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  37.5 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>