More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1890 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  248  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  49.35 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  50 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  46.48 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  50 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  50 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  58.18 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  47.83 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  41.86 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 91 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8538  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000674281  hitchhiker  0.0000867328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  42.86 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  36.47 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  45 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.92 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  45 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.11 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>