192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6198 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  210  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 81 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 81 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  62.96 
 
 		 81 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  69.23 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  58.02 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  63.08 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  51.95 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  48.72 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  50.67 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  47.44 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  42.03 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  48.39 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  55.77 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  50.85 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  47.62 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  48.39 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  49.18 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  47.62 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  57.41 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  49.09 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 390 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  41.89 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  44.26 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  41.27 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  42.62 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  51.02 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  51.02 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  36.92 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>