247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1921 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  42.19 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  38.46 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  43.55 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  43.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  43.33 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.24 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0231  hypothetical protein  37.7 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 370 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1786  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  36.07 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  35.48 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  34.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04285  DNA-binding protein, putative  40.3 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  32.2 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>