217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0529 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 75 aa  51.6  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 410 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 488 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 107 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 67 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 91 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 91 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 77 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 78 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 68 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 91 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  36.36 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 489 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 432 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 380 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 88 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 359 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0147  DNA-binding transcriptional regulator  36.92 
 
 		 74 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.83 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 112 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 77 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.17 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30.17 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  34.18 
 
 		 86 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.94 
 
 		 267 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  36 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  41.33 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  45 
 
 		 79 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 76 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 122 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 97 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 118 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.43 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 377 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 116 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 262 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35.38 
 
 		 72 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 90 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 374 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  38.98 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  33.87 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 490 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  31.88 
 
 		 488 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  44 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>