77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2567 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  57.84 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  40.32 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  40.58 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.92 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 400 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2264  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 410 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  46.03 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 396 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  40.58 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 370 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 459 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  31.75 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  36.92 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  32.84 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 117 aa  42  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  32.84 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4492  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 111 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  27 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 152 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  32.26 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  26.6 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 87 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0404  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 215 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  33.33 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  28.4 
 
 		 430 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  37.5 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1330  hypothetical protein  31.94 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.610608  normal  0.0456597 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.34 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  34.72 
 
 		 270 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 93 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 380 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  37.68 
 
 		 243 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  27.55 
 
 		 302 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>