171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7699 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 410 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 321 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  31.87 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  36.99 
 
 		 399 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  35.05 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 230 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  33.03 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  33.77 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  36.59 
 
 		 394 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  27 
 
 		 302 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  34.92 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 396 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  32.73 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 231 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.09 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  34.41 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  34.41 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  34.41 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  29.73 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  39.34 
 
 		 259 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2264  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  27.45 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  40.68 
 
 		 386 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  39.29 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  38.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  39.39 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 482 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 483 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 152 aa  42  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  27.43 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 113 aa  42  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>