116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2653 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  52.85 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
132 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  52.38 
 
 
132 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  51.59 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  51.18 
 
 
133 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  57.97 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2831  helix-turn-helix domain-containing protein  41.13 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182633  normal  0.128352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1947  transcriptional regulator protein  35.16 
 
 
210 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  39.39 
 
 
213 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  36.99 
 
 
296 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.33 
 
 
235 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  36.49 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  36.49 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42.62 
 
 
227 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  33.72 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 
206 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
273 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  35.48 
 
 
209 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.72 
 
 
233 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
229 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  41.89 
 
 
219 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
229 aa  47  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
222 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.72 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0051  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.72 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.88 
 
 
436 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0962  DNA-binding protein  32.95 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.38 
 
 
240 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  33.33 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.38 
 
 
240 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  33.33 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  28.05 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  31.25 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31.94 
 
 
342 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  36.71 
 
 
219 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  37.88 
 
 
239 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.25 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.29 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.25 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  37.31 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  31.75 
 
 
327 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
300 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1507  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
260 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00000450158  hitchhiker  0.000000420846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  42.47 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.82 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  33.87 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  28.38 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 
459 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
364 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
380 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00600  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1953  normal  0.198014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
110 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
255 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0666  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
150 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  34.43 
 
 
229 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  32.31 
 
 
262 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.88 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  30 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 
256 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
490 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 
410 aa  40.8  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 
262 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  38.89 
 
 
233 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.31 
 
 
262 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>