97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2432 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 474 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  45.1 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 470 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 470 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  34.92 
 
 		 483 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  35.48 
 
 		 476 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 469 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4071  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 464 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 478 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3685  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 504 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0310  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.506385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0317  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 477 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3617  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  36.21 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 469 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 469 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.38 
 
 		 196 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 370 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 483 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 482 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  36.92 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 199 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.42 
 
 		 481 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 480 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 251 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 480 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 488 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 433 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  34.48 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 477 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1121  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 		 88 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 83 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 81 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 483 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 188 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 188 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 181 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 188 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>