40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2004 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  36.28 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.77 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.77 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.77 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 139 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  32.91 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  37.5 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  27.55 
 
 		 303 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 284 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 194 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>