More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1393 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 90 aa  176  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  67.82 
 
 		 93 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  67.86 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  65.93 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  68.92 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  58.23 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  67.12 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2824  hypothetical protein  64.15 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3064  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  43.33 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  45 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  40.32 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  38.36 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  39.39 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  41.67 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  41.67 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  34.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  39.06 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  39.06 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  43.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  38.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>