97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01539 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  56.82 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  56.82 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  52.8 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  51.39 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  51.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  51.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  45 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  45 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  45 
 
 		 216 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  53.12 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  53.12 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  45.21 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  46.97 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  45.83 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  44.12 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  44.12 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  42.86 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  42.47 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1829  HTH-type transcriptional regulator DicA  64.1 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000216538  hitchhiker  0.000000000000147323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3170  HTH-type transcriptional regulator DicA  64.1 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000404203  hitchhiker  7.709190000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  43.28 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  42.86 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  38.46 
 
 		 236 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  31.78 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  38.81 
 
 		 209 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.36 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.36 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.36 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.33 
 
 		 235 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  38.1 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0164  hypothetical protein  27.84 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0185  sensory box protein  27.84 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  36.51 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0775  hypothetical protein  36.96 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0955  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  40.58 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 104 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  33.75 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  30.84 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  36.92 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  39.47 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 403 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1102  sensory box protein  26.8 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 197 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  27.54 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  34.85 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1189  hypothetical protein  35.87 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.03 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.33 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 252 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  36.92 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 403 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>