51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1163 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 129 aa  264  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  36.44 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  43.28 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  36.44 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  43.28 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  37.68 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  37.68 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  37.68 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  38.14 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  36.99 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  31.58 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  34.85 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  34.85 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.36 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30.28 
 
 		 229 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.28 
 
 		 229 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 		 355 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  33.8 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  30.43 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  40 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.38 
 
 		 263 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12390  4-diphosphocytidyl-2-methyl-D-erythritol synthase  43.42 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  48.33 
 
 		 236 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  39.06 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  38.57 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  31.48 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2742  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.224201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  31.34 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  37.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 93 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  38.1 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4206  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000156355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 206 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>