More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3718 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  42.49 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2596  putative prophage repressor  40.82 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4974  peptidase S24 and S26 domain protein  36.65 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.91 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2517  peptidase S24 and S26 domain protein  36.63 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983902  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  43.44 
 
 		 148 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.61 
 
 		 138 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  35.61 
 
 		 138 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.61 
 
 		 138 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.4 
 
 		 143 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  34.69 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  35.35 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  31.28 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  31.28 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  36.41 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  37.59 
 
 		 150 aa  85.1  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.94 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.26 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  33.5 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  35.8 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  35.8 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4056  LexA family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  35.8 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  31.16 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  31.25 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  33.15 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  33.68 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  39.58 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  30.9 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  32.97 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  34.66 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  33.15 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  34.97 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  40.43 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.78 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.24 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  29.63 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  31.28 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  32.6 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  43.7 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  30.9 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  34.29 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  30.54 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  30.61 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.47 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  32.62 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  33.33 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  31.91 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  30.33 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  40.34 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  35.54 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  33.71 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  29.27 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  35.71 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  34.96 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  38.84 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  33.49 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.82 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  35.26 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  31.67 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.47 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  34.46 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.88 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  32.54 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  31.05 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.3 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  31 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  31.58 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  31.58 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2300  LexA family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  31.58 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  38.98 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.46 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  35.29 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  29.09 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.77 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  30.5 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  33.85 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.82 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  36.67 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  31.07 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  31.84 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  32.58 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  30.39 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>