More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4056 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4056  LexA family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2300  LexA family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  43.28 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  38.25 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  37.93 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  37.93 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  37.93 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  36.95 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  37.44 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  37.56 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  36.95 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  37.56 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  36.11 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  37.13 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  38.25 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.73 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  35.78 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  37.81 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  37.44 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  36.11 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  37.37 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  37.13 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  37.93 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  36.63 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  36.87 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  36.11 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  36.11 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  37.5 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  37.02 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  37.5 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  38.64 
 
 		 227 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  37.31 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  37.88 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  36.1 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.37 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  37.16 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  37.88 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  35.82 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  37.13 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  37.5 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  37.71 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  34.47 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  36.49 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  35.5 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  36.49 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  39 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  36.68 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  36.97 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  36.49 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  34.67 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  36.18 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  36.63 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  36 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  36.87 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  37.85 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.44 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.61 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  35.86 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  34.67 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  34.48 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  36.32 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  36.32 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32.49 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  32.49 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  35.12 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  36.87 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  34.43 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  36.15 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  31.76 
 
 		 234 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.38 
 
 		 226 aa  97.8  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>