More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1516 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  99.53 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  99.53 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  99.53 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  99.53 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  97.67 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  96.28 
 
 		 235 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  96.28 
 
 		 215 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  95.35 
 
 		 235 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  90.74 
 
 		 216 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  89.81 
 
 		 216 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  89.81 
 
 		 216 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  72.56 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  72.64 
 
 		 216 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  72.64 
 
 		 216 aa  304  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  71.7 
 
 		 216 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  70.23 
 
 		 218 aa  300  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  67.89 
 
 		 225 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  68.95 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  68.95 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  67.12 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  64.57 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  64 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  66.67 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  63.93 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  64.84 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  64.19 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  63.27 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0426  transcriptional repressor, LexA family  57.66 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  57.66 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  56.28 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  55.35 
 
 		 203 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  55.81 
 
 		 202 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  54.42 
 
 		 202 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  54.88 
 
 		 202 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  53.95 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  53.95 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  53.95 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  54.98 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.29 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  54.98 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  54.5 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  55.4 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  54.98 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  54.5 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  54.98 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  54.5 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  56.81 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  54.5 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  54.98 
 
 		 202 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  57.42 
 
 		 201 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  54.03 
 
 		 202 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  57.14 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  53.95 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.87 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  53.02 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  54.67 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  53.52 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  55.71 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  53.49 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  54.42 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  58.06 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  52.56 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  52.09 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  54.42 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  53.02 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  53.99 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.49 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  52.58 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  56.5 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00268  LexA repressor  56.28 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002149  SOS-response repressor and protease LexA  55.81 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2893  LexA repressor  56.13 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  53.55 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0260  LexA repressor  51.63 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3780  LexA repressor  50.7 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4110  LexA repressor  51.63 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4309  LexA repressor  51.63 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0156  LexA repressor  51.63 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>