More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2596 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2596  putative prophage repressor  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  44.68 
 
 
194 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  40.82 
 
 
199 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4974  peptidase S24 and S26 domain protein  32.86 
 
 
212 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2517  peptidase S24 and S26 domain protein  32.14 
 
 
192 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983902  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  37.7 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.45 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.55 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  33.63 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.57 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.04 
 
 
143 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  35.29 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.29 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  36.69 
 
 
147 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  35.48 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  32.83 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  32.52 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  32.99 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  33.06 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  32.83 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  28.26 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  33.61 
 
 
137 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  34.69 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  29.84 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  28.42 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  31.55 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  32.12 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.34 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  33.88 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  32.79 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  26.52 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  36.19 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  32.83 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.25 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  36.26 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.51 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.62 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  26.34 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  36.63 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  36.63 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  26.64 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  27.35 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  27.35 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  36.56 
 
 
139 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  29.12 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00150  LexA repressor  37.5 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  30.33 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  35.66 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  28.97 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  35.83 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  28.88 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  31.15 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  30.04 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  35.92 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  28.57 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.51 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  33.61 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  27.01 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  47.13 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4056  LexA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  30.81 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  27.49 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.41 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  47.13 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  33.94 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  27.17 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  32.26 
 
 
141 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.71 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  31.71 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  31.71 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.02 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  37.84 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  45.98 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  31.71 
 
 
139 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  45.98 
 
 
239 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  29.17 
 
 
146 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  29.11 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  26.67 
 
 
231 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  33.68 
 
 
151 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  36.04 
 
 
142 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  28.69 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  43.68 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  25.59 
 
 
227 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  25.59 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  26.78 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  43.68 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  37.38 
 
 
157 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  26.7 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  36.13 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  26.78 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>