60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2539 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 209 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  34.09 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  34.62 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  32.67 
 
 		 234 aa  57  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  32.82 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  33.09 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  32.82 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  31.51 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.03 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  31.51 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  34.25 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  30.99 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  29.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  40 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  27.34 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  30.99 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  31.51 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.95 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  30.56 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  30.25 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  30.25 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  30.07 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 240 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  27.82 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  27.07 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  27.07 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  28.09 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.8 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  31.53 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  33.8 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  32.35 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  35.21 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  38.16 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  30.08 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 240 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  30.94 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.56 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  30.3 
 
 		 217 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.7 
 
 		 207 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  29.58 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.79 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  28.12 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.34 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  31.25 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  30.23 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  37.25 
 
 		 228 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  34.78 
 
 		 214 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>