134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0863 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  88.46 
 
 		 208 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  89.05 
 
 		 210 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  80.95 
 
 		 210 aa  358  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  87.62 
 
 		 210 aa  354  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  80 
 
 		 210 aa  353  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  58.67 
 
 		 225 aa  275  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  60 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  55.76 
 
 		 217 aa  260  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  56.19 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  53.81 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  52.86 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.38 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  58.93 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  56.42 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  56.42 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  57.67 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  54.42 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  51.12 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  58.06 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  55.11 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  54.22 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.12 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.72 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  45.93 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  39.44 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  40.57 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  36.43 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  34.4 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  28.48 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  35.64 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  29.15 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  29 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  33.72 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.47 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  33.86 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  33.96 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  39.53 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  38.37 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  39.53 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  34.94 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  32.26 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.91 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.46 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  19.61 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.25 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.33 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.15 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.15 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.15 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  33.33 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  26.92 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.05 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  28.46 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  27.05 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  27.05 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  34.07 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  36.05 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  36.14 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  34 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.07 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  32.85 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.28 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.27 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  34.88 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  35.14 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  34.88 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.73 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  36.05 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  31.48 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  38.03 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  36.05 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.77 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  25.23 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.28 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  32.65 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.63 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  32.56 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.78 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.74 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.65 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.86 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  33.72 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  27.35 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  32.69 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  28.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>