98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0018 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  100 
 
 		 214 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  65.9 
 
 		 217 aa  294  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  66.67 
 
 		 218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  66.67 
 
 		 218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  60.28 
 
 		 210 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  59.82 
 
 		 224 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  59.35 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  60.93 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  58.88 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  60 
 
 		 214 aa  255  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  57.67 
 
 		 210 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  57.21 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  57.67 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  55.11 
 
 		 225 aa  247  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  57.21 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  66.2 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  61.78 
 
 		 225 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  61.78 
 
 		 225 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  54.84 
 
 		 219 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  56.74 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  55.81 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  51.11 
 
 		 223 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.34 
 
 		 209 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  51.42 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  44.19 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  45.76 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  32.22 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  37.14 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  35.58 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  30.23 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  31.29 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  32 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  31.37 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  31.37 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  28.11 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  32.74 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  38.89 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.78 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  33.86 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  26.19 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  36.11 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  35.14 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  33.93 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  33.63 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  31.53 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  26.03 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  26.03 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  30.56 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.12 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  32.28 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  33.65 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  38.46 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  30.63 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  29.31 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  29.2 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  29.2 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  30.83 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  31.17 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  21.53 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  43.24 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  43.24 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  30.36 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  32.73 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  29.49 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  33.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  32.43 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.93 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.26 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  28.77 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.12 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  37.31 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  25.13 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  33.04 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.45 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.45 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.45 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.07 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.74 
 
 		 233 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  36.99 
 
 		 240 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  38.55 
 
 		 240 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  38.55 
 
 		 239 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.61 
 
 		 220 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  37.35 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  27.54 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  36.14 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  36.14 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>