27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3576 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  52.41 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  36.46 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  32.31 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  38.13 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  32.46 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  36.18 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  32.82 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  39.37 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  33.33 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  37.69 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  31.22 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  31.96 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  28.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  28.9 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  28.71 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  28.23 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0775  hypothetical protein  23.41 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1189  hypothetical protein  24.62 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  29.61 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  26.84 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  27.92 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.48 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>