29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3689 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  32.58 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  36.36 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  40.6 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  38.06 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  33.33 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  38.1 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  39.37 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  30.48 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  36.51 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  32.58 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  34.16 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  33.58 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  33.82 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  32.82 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  27.27 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  38.1 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  41.25 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.2 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  34.9 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  28.35 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  34.65 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  36.51 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  35.64 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  31.86 
 
 		 219 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>