22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3360 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  39.49 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  42.75 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  40.43 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  33.33 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  32.31 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  36.55 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  35.07 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  31.13 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  32.17 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  30.96 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  27.27 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  35.25 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  36.36 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  33.83 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  31.97 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  23.11 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  30.16 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  33.93 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>