35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3423 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  100 
 
 		 191 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  97.91 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  33.33 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  36.51 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  34.92 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  29.13 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  30.89 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  35.48 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  31.38 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  30.69 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  31.3 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  32.03 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  32.31 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  35.66 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  32.33 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  28.29 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  29.41 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  33.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.86 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  34.95 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  38 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  33.59 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  30.15 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  28.91 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  32.79 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  33.6 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  32.08 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  33.6 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  30.15 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  23.92 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  27.62 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.7 
 
 		 210 aa  42  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  30.53 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>