93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4030 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  90.83 
 
 
218 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  90.83 
 
 
218 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  61.29 
 
 
210 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  61.16 
 
 
224 aa  272  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  59.91 
 
 
210 aa  271  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  65.9 
 
 
214 aa  271  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  58.53 
 
 
208 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  55.76 
 
 
210 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  63.56 
 
 
225 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  56.88 
 
 
210 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  56.42 
 
 
210 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  54.19 
 
 
225 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  63.11 
 
 
225 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  56.88 
 
 
214 aa  248  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  55.5 
 
 
210 aa  248  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  55.5 
 
 
210 aa  248  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  65.3 
 
 
215 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  58.06 
 
 
210 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  58.99 
 
 
210 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  50 
 
 
219 aa  214  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  47.09 
 
 
223 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.39 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.98 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  42.2 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  40.78 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  37.38 
 
 
421 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  38.37 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  32.8 
 
 
331 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  29.72 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  27.52 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  28.64 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  32.33 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  39.42 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  32.33 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  27.53 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  32.06 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  29.49 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  35.16 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.4 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  27.84 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  34.83 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  27.69 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  36.14 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.74 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  25.2 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  24.42 
 
 
209 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  29.81 
 
 
196 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.36 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  34.65 
 
 
227 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  34.96 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  39.74 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.11 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  32.58 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.77 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  20.79 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.59 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.06 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  37.72 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  42.86 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  31.01 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  41.56 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.86 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  25.49 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  30.68 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  38.14 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  25.58 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  28.31 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  29.27 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  28.91 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  39.13 
 
 
107 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  36.14 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  35.96 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  30.17 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  33.73 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.9 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.79 
 
 
564 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  30.16 
 
 
214 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  34.12 
 
 
233 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  41.56 
 
 
237 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 
242 aa  41.6  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  40.26 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.27 
 
 
573 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>