28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4537 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  72.73 
 
 
209 aa  307  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  60.48 
 
 
210 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  59.52 
 
 
210 aa  255  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  60.48 
 
 
210 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  60.48 
 
 
210 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  48.31 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  45.63 
 
 
210 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  47.44 
 
 
217 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  45.89 
 
 
208 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  43.2 
 
 
210 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  46.67 
 
 
224 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  45.63 
 
 
210 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  49.06 
 
 
214 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  45.41 
 
 
210 aa  187  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  47.34 
 
 
214 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  42.6 
 
 
225 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  47.91 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  47.91 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  47.14 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  45.33 
 
 
219 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  46.67 
 
 
225 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  48.83 
 
 
215 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  45.07 
 
 
208 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  39.91 
 
 
223 aa  147  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  42.42 
 
 
217 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.11 
 
 
238 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  25.4 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.260786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>