75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0792 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  90.83 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  66.67 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  59.63 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  62.5 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  58.26 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  56.88 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  56.42 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  66.22 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  68.18 
 
 		 215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  65.78 
 
 		 225 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  56.16 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  54.63 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.71 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  55.25 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  55.25 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  56.42 
 
 		 214 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  57.34 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  57.34 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  51.58 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.05 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  45.78 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.61 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.38 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  37.5 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  30.71 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  36.47 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  31.5 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  27.4 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  35.43 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  29.14 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.98 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.3 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  27.41 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  23.98 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  26.79 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  22.17 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  31.2 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.39 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  32.58 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  34.94 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  35.29 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.14 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  26.84 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.91 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  33.03 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  20.93 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  40.58 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.28 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  29.24 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  38.46 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  35.64 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  31.58 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  27.64 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  30.68 
 
 		 120 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  38.16 
 
 		 224 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  35.23 
 
 		 236 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  23.26 
 
 		 213 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 242 aa  42  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.5 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  31.33 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  24.68 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>