56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0133 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  55.96 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  54.42 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  53.95 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  57.48 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  54.72 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  53.27 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  50 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  52.11 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  50 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  52.58 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.11 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  55.35 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  54.88 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  54.84 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  50.66 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  51.58 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  51.58 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  48.68 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.64 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  53.67 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  50 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  49.56 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.33 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.72 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  41.48 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  27.87 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  30.95 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  31.78 
 
 		 421 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  28.68 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.72 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  32.76 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  31.3 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  29.65 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  27.04 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.84 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  24.86 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.35 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  32.26 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  25.31 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  27.61 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  26.49 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  27.89 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  31.86 
 
 		 227 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  28.23 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.67 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.67 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.67 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>