65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0472 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  33.33 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  30.47 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  39.53 
 
 		 331 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  30.85 
 
 		 421 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.28 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  24.75 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  27.53 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  30.06 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  27.75 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.18 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  29.03 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  34.26 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  34.26 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  27.33 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.5 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25.9 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  23.53 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  23.93 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  25.14 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.11 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  33.94 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.41 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  38.24 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  30.43 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  25.87 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  21.76 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  28.69 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.73 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.42 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  40 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  23.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  24.72 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  21.43 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.58 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  26.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  30.69 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  28.16 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  20.57 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  35.19 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  23.53 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 133 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  23.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  24.56 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  30.3 
 
 		 244 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  21.11 
 
 		 264 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.57 
 
 		 264 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 138 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  29.13 
 
 		 214 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>