50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4739 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  272  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  84.5 
 
 		 133 aa  203  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 135 aa  163  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 136 aa  156  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.27 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  46.03 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  41.22 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  37.78 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  32.31 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  34.96 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  33.65 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  44.23 
 
 		 251 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0772  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  34.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  37.93 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6073  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 148 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 87 aa  40  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 474 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>