32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4478 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  77.37 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  72.99 
 
 		 138 aa  209  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  76.26 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  65.67 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  65.91 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  64.34 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  61.94 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  64.89 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  64.12 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  61.07 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  75.23 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  59.09 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  55.38 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.48 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>