30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0054 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  82.35 
 
 
137 aa  222  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  80.74 
 
 
137 aa  216  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  76.87 
 
 
134 aa  205  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  79.7 
 
 
133 aa  201  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  71.94 
 
 
139 aa  201  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  65.91 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  63.85 
 
 
141 aa  175  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  64.62 
 
 
139 aa  174  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  60.77 
 
 
138 aa  166  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  61.59 
 
 
131 aa  157  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  50.74 
 
 
144 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  65.14 
 
 
110 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.42 
 
 
136 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  41.09 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 
135 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  44.35 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  39.55 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  38.17 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  38.17 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>