41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0632 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  73.28 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 136 aa  187  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 138 aa  187  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  70.99 
 
 		 131 aa  186  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  66.14 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.25 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  41.09 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  39.01 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  39.57 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  36.92 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  35.38 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  37.32 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  36.64 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  36.57 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  33.83 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  33.62 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  35.29 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.29 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 474 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  33.85 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>