56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4874 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  84.5 
 
 		 132 aa  203  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.09 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  45.11 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  39.84 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  37.59 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  34.92 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  34.68 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  35.43 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  34.35 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  37.59 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  46.15 
 
 		 251 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6073  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0772  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  38.71 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  34.57 
 
 		 303 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  37.1 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  37.1 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6134  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 139 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 72 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 229 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>