30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0967 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  61.07 
 
 
140 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  55.97 
 
 
131 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  51.47 
 
 
139 aa  154  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  50.75 
 
 
133 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  56.82 
 
 
141 aa  147  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  52.9 
 
 
137 aa  146  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  53.79 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  50.74 
 
 
134 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  47.76 
 
 
134 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  49.63 
 
 
135 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
138 aa  137  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
136 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  48.23 
 
 
138 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  45.32 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 
138 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 
138 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  50.89 
 
 
110 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 
129 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 
127 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  44.36 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  39.01 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>