54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3420 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  35.94 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 
410 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  53.06 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  31.25 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
333 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
333 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  32.26 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.6 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  43.4 
 
 
270 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
513 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
79 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 
69 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  33.87 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  33.87 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  32.81 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  32.81 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  32.81 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  33.87 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  46 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
474 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 
497 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>