50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2157 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 131 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  43.48 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  42.42 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  38.93 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  40.15 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  39.26 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  39.55 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  41.13 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  39.83 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  37.88 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  40.62 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36.71 
 
 		 328 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  39.34 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  33.33 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 380 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 474 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 142 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>