175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2271 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  38.67 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.06 
 
 		 376 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  31.82 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.84 
 
 		 377 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  34.72 
 
 		 377 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  46 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 229 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  46.3 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.68 
 
 		 377 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  38.36 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 446 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  41.51 
 
 		 383 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  34.38 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  43.14 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  36.07 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  36.07 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  36.07 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  52.63 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 142 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 135 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 158 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  36.07 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 190 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 79 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 69 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  39.34 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  36.17 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2215  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477213  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5293  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 297 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.24 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>