39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3628 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  81.16 
 
 		 138 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  71.32 
 
 		 127 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 131 aa  176  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  69.84 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  62.5 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  48.57 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  41.48 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  41.61 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  39.53 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  39.69 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  38.06 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  37.01 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  37.88 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  38.81 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  38.85 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  36.63 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.87 
 
 		 256 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  33.87 
 
 		 256 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 262 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 262 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>