38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1284 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
127 aa  259  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  73.28 
 
 
131 aa  191  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  71.01 
 
 
138 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  72.87 
 
 
129 aa  184  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  71.32 
 
 
135 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  71.76 
 
 
131 aa  183  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  69.85 
 
 
136 aa  183  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  69.63 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 
138 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  65.94 
 
 
138 aa  176  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  69.84 
 
 
129 aa  167  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 
138 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  67.67 
 
 
133 aa  156  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  62.22 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.97 
 
 
136 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  58.27 
 
 
137 aa  146  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  44.29 
 
 
144 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  44.62 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  41.09 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  41.04 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  39.23 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  37.69 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  38.64 
 
 
137 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  39.06 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  37.01 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  38.52 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  35.77 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  36.94 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  36.23 
 
 
459 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  25.51 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
244 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  25.76 
 
 
224 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.404493 
 
 
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NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0998227 
 
 
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NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
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