38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3720 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  282  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  81.16 
 
 		 135 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  80.58 
 
 		 135 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  77.54 
 
 		 136 aa  215  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  76.26 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  76.26 
 
 		 138 aa  209  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 131 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  64.54 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  64.03 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  63.31 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  48.23 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  43.17 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  43.94 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  39.23 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  40.43 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  37.12 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  39.26 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  40.35 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  33.87 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.87 
 
 		 256 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 224 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>