41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5792 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  39.04 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.04 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  34.12 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  33.33 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  26.44 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  25.74 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  28.51 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  33.06 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  28.81 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  32.67 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  31.13 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.1 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  26.96 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  28.03 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  33.96 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  29.69 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6165  hypothetical protein  40.91 
 
 		 110 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  29.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  30.86 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  33.04 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.38 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  30.56 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  27.83 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  31.48 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  29.45 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.63 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  25.64 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  27.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  27.01 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  26.36 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  27.19 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  27.19 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  28.91 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  26.47 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  29.55 
 
 		 421 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  23.7 
 
 		 331 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  29.33 
 
 		 238 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>