111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0549 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  81.9 
 
 		 210 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  81.43 
 
 		 210 aa  358  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  80.95 
 
 		 210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  59.52 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  56.19 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  57.55 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  57.82 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  55.5 
 
 		 217 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  59.05 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  57.08 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  59.52 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  52.17 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  57.14 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  55.56 
 
 		 224 aa  237  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  60.93 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.92 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  56.16 
 
 		 218 aa  228  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  56.16 
 
 		 218 aa  228  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  57.48 
 
 		 219 aa  226  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  58.99 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  54.87 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  54.87 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  47.77 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  46.45 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  42.17 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  32.45 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  30.37 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  28.74 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  27.48 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  28.36 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  28.3 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.53 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.31 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.58 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  37.23 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  31.49 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.23 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  28.04 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.51 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  28.91 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  27.32 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  26.03 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  20.69 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  29.5 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  37.84 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  36.47 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  38.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.44 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  27.81 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  33.73 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  36.59 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  29.41 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  31.87 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  27.83 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.98 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  34.18 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  34.52 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  31.25 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  30.77 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  32.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  36.62 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  36.62 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  34.94 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  32.94 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  29.67 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  34.94 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  36.62 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  27.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  28.37 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  25.53 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  32.22 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  30.77 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.87 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  30.77 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  35.9 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  28.1 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  34.43 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  30.85 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  36.14 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.88 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.39 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.26 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  26.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  26.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  43.66 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  43.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.95 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  28.05 
 
 		 120 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>