29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1918 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  37.93 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  33.48 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  40.62 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  28.88 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  29.13 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  33.79 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  28.64 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  25.45 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  26.02 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  33.82 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  25.45 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  25.65 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  34.91 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  25.66 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.96 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  28.03 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  32.76 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  26.03 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  30.23 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  29.46 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  24.37 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  33.64 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  31 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  28.57 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  31.51 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.57 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>