42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5832 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  58.39 
 
 		 230 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  38.97 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  47.37 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  39.71 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  31.37 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  37.12 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  33.08 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  34.29 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  34.59 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.5 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  30.36 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  30.39 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  32.45 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  32.03 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  50.91 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  28.14 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  27.14 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  30.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  27.14 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  35.66 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  35.16 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  36.11 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.11 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  36.11 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5087  transcriptional regulator, XRE family  27.89 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2499  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  47.62 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  31.25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  28.86 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  37.04 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  27.69 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.92 
 
 		 238 aa  44.7  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  28.68 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  26.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.25 
 
 		 220 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  30.82 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>