26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3844 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  53.74 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  34.86 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  32.54 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  32.42 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  31.1 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.53 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  22.77 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  31.97 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  49.18 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  47.54 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6165  hypothetical protein  49.18 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  32.24 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  27.37 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  34.84 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  29.44 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  32.18 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  26.72 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  27.78 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  27.42 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.9 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  32.18 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 158 aa  41.6  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>